Unter Funktionsdiagnostik versteht man in der Zahnheilkunde die Analyse von Störungen im Bereich der Kiefergelenke und der Kaumuskulatur und deren Auswirkungen auf den menschlichen Organismus. Diese könne durch Fehlstellungen im Bereich der Zähne oder von benachbarten, anatomischen Strukturen hervorgerufen werden.
Dadurch verursachte Erkrankungen heißen Craniomandibuläre Dysfunktionen (CMD).
Die Funktionstherapie kann in Form einfacher Verhaltensänderungen, über Eingliedern einer Schiene bis zur Neugestaltung der Artikulations- und Okklusionsverhältnisse erfolgen.